معلومة

إعادة ترسيخ لوحات أجار المضطربة

إعادة ترسيخ لوحات أجار المضطربة


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

أنا عالق في مشكلة أثناء صب أجار LB على أطباق بتري الخاصة بي. اضطررت إلى إضافة الكاناميسين إلى لوحاتي قبل أن تبدأ في التصلب ، بسبب النسيان ، الذي حاولت مزجه باستخدام الطرف. كانت اللوحة مثل هذه الكارثة! هل هناك طريقة لإذابة الأجار في اللوحة وإعادة ترسيخه بالتساوي.
أستخدم طبق بتري بلاستيكي معقّم من الصقر.


نعم فعلا. انها بسيطة جدا في الواقع. افعل هذا داخل غطاء صفيحي نظيف:

  • خذ شفرة مشرط نظيفة معقمة أو أي أداة طويلة معقمة أخرى. 1 مل ماصة سيفي بالغرض أيضًا.
  • قطع أجار على طبقك. كشط نظيفة.
  • ضعه في زجاجة معقمة.
  • تسخينها في الميكروويف
  • أضف كاناميسين
  • صب مرة أخرى

الحل الآخر هو طلاء سطح الأجار بالكاناميسين تمامًا مثل الطلاء المنتشر. تحقق من التركيزات المناسبة.


اسأل خبير: اختبارات طبق أجار بيتري؟

هل تخطط لعمل مسحات على شيء آخر غير الأوراق؟ ما هي فرضيتك؟ ما السؤال الذي تحاول الإجابة عليه من خلال تجاربك؟
أفترض أنك تستخدم أطباق أجار المغذية لأن هذا هو ما يستخدمه معظم الطلاب ، لذلك ستحصل على بعض الفطريات - العفن والخمائر - التي تنمو على الأجار وكذلك بعض البكتيريا. حاول إبقاء الألواح في درجة حرارة 78-85 فهرنهايت (26-30 درجة مئوية). إذا كانت شديدة البرودة ، فلن تنمو الكائنات الحية الدقيقة بشكل جيد.

يمكنك طرح السؤال التالي: هل يوجد المزيد من البكتيريا أو الفطريات على السطح العلوي أو السفلي من الورقة؟ قد يتعرض السطح العلوي لأشعة الشمس والأشعة فوق البنفسجية الموجودة في ضوء الشمس ضارة لأنواع كثيرة من البكتيريا. وبالتالي قد تتنبأ بأنك ستجد عددًا أكبر من أنواع البكتيريا على الجانب السفلي من الورقة مقارنةً بالجزء العلوي. الفطريات أكثر مقاومة لأشعة الشمس وقد لا تظهر هذا التأثير.

سيتعين عليك عمل مسحات من عدة أنواع من النباتات لأن الأوراق تختلف كثيرًا في التركيب والاستعمار الميكروبي. إذا كان لديك عدد محدود من اللوحات ، فيمكنك تقسيم منطقة أجار إلى نصفين عن طريق رسم خط عبر المركز أسفل طبق بتري باستخدام Sharpie. بعد ذلك ، يمكنك عمل مسحتين عليه - أحدهما من السطح العلوي للورقة والآخر من الأسفل ومقارنتهما مباشرةً عن طريق التقاط صورة.

عندما تقوم بعمل مسحات على أجار المغذيات ، فهناك فرصة لتنمية مسببات الأمراض البشرية الخطيرة ، لذلك بعد أن تمسحها ، أغلق الغطاء إلى الأسفل بشريط لاصق ولا تفتحه. يمكنك التقاط الصور من خلال الغطاء البلاستيكي الشفاف.

بعد الانتهاء من تجربتك بالكامل ، قم بتعقيم الألواح بالأوتوكلاف إذا استطعت ، وإذا لم يكن الأمر كذلك ، فاملأ دلوًا بنسبة 10٪ كلوروكس وضع الأطباق في السائل. اتركهم هناك لبضعة أيام. سيتسرب الكلوروكس إلى الداخل ويقتل البكتيريا. ثم يمكنك التخلص منها في سلة مهملات الخطر البيولوجي في مدرستك.


الملخص

متحولة جديدة من أرابيدوبسيس اسم الشيئ rha1 يتم تمييزه واستنساخ الجين المعني. في الجذور ، يُظهر المسوخ الحد الأدنى من الميل الأيمن ، واستجابة الجاذبية المنخفضة ، ومقاومة ملحوظة لـ 2،4-D ، ولكن مقاومة نادرة لـ IAA و NAA. تظهر الجذور أيضًا مقاومة واضحة لمثبطات نقل الأكسين TIBA و NPA والإيثيلين. الخصائص الأخرى هي انخفاض عدد الجذور الجانبية وتقليل حجم الجذع والجذر في الشتلات. تم العثور على الجين ، المستنسخ من خلال TAIL-PCR ، ليكون عامل صدمة حرارية يرسم خرائط على الكروموسوم 5 ، بالقرب من وفوق علامة RFLP m61. ال rha1 تم الإبلاغ عن بنية ، مرنا ، ومنتج ترجمة. منذ ذلك الحين ، حتى الآن ، لم يتم وصف أي طفرة جاذبية أخرى بأنها تحورت في عامل الصدمة الحرارية ، rha1 ينتمي إلى مجموعة جديدة من المسوخ المضطرب في الانحدار ، والجاذبية ، وعلم وظائف الأعضاء auxin. كما هو موضح من خلال تحليلات RT-PCR لتعبيرها ، يحتفظ الجين بالوظيفة المرتبطة بالصدمة الحرارية. إذا تم النظر في الخصائص المرتبطة بعلم وظائف الأعضاء auxin ، فمن المحتمل أيضًا أن يكون الجين ، كعامل نسخ ، متورطًا في دوران الجذر ، واستجابة الجاذبية ، والتحكم الهرموني في التمايز. نظرًا لأن تلطيخ GUS تحت محفز الجينات كان موضعيًا بشكل رئيسي في الأنسجة الناضجة ، rha1 لا يبدو أنه متورط في الخطوات الأولى من الجاذبية ، ولكنه مرتبط بالاستجابة العامة للأوكسين. تؤدي التغييرات في الميل (ويرجع ذلك أساسًا إلى انخفاض الدوران الدائري) والجاذبية إلى افتراض أن العمليتين قد يكون لهما ، على الأقل جزئيًا ، أصول مشتركة.


الملخص

وقد لوحظ موت النباتات في مناطق جبال الألب وشبه الألبية في أستراليا. على الرغم من عدم تحديد المسببات المرضية التفصيلية ، إلا أن بقع النباتات المحتضرة والترقق التدريجي للمظلة تشير إلى تورط مسببات الأمراض الجذرية. أدى اصطياد الجذور وما يرتبط بها من تربة الجذور من المسوحات التي أجريت في المناطق الجبلية نيو ساوث ويلز وتسمانيا إلى عزل ثمانية فيتوفثورا محيط نبات نبات الصبار, كريبتوجيا فيتوفثورا, نبات فيتوفثورا فلاكس, فيتوفثورا gonapodyides, فيتوفثورا جريجاتا, Phytophthora pseudocryptogea، ونوعين جديدين ، Phytophthora cacuminis ص. نوفمبر و فيتوفثورا أوريوفيلا ص. نوفمبر ، الموصوفة هنا. ص. الكمون ص. نوفمبر يرتبط ارتباطًا وثيقًا بـ ص. مغالطة، وعُزلت عن الأعراض أوكالبتوس كوكيفيرا وأنواع من الأسرة بروتيا في Mount Field NP في تسمانيا. ص. أوريوفيلا ص. nov ، من أعشاب جبال الألب المضطربة في حديقة Kosciuzsko الوطنية. تشير درجة الحرارة الأساسية المنخفضة لنمو الأنواع الجديدة إلى أنها مهيأة جيدًا للبقاء على قيد الحياة في ظل هذه الظروف ، ويجب اعتبارها تهديدات محتملة للنباتات المتنوعة للنظم الإيكولوجية شبه الألبية / الألبية. ص. gregata و ص. التشفير سبق أن تورطت في تدهور صحة النبات. هناك حاجة الآن لإجراء اختبارات على مجموعة من أنواع نباتات جبال الألب / تحت الألب لتحديد قدرتها المرضية ، ومدى العائل ، وإمكاناتها الغازية.


نقاش

تنظيم ما بعد النسخ من الجاذبية

تم إجراء تحليل البروتينات خلال النقاط الزمنية المبكرة بعد تحفيز الجاذبية الباردة لاستجابة GPS لتحديد المكونات الإضافية لمسار إشارات الجاذبية. لوحظت تغيرات سريعة سابقًا في التعبير الجيني (Kimbrough et al. ، 2004) وفي إشارات الجزيئات ، ولكن هذه هي الدراسة الأولى التي تبحث في التغيرات في وفرة البروتين استجابةً لإعادة التوجيه إلى ناقل الجاذبية في سيقان الإزهار. أرابيدوبسيس.

تم إثبات أن الرسل الثاني الكلاسيكي مثل Ca 2+ و inositol 1،4،5-triphosphate يتدفق في أقل من دقيقة واحدة بعد تحفيز الجاذبية (Perera et al. ، 1999 ، 2001 Toyota et al. ، 2008). ثبت أن المكونات الأخرى مثل التغيير في الرقم الهيدروجيني وتوليد أنواع الأكسجين التفاعلية مرتبطة وضرورية للاستجابة الجاذبية (Scott and Allen ، 1999 Joo et al. ، 2001). باستخدام نهج البروتينات الهلامية القائمة على الرحلان الكهربي ثنائي الأبعاد ، يونغ وآخرون. (2006) حدد أدينوزين كيناز 1 على أنه زيادة في التعبير بمقدار 1.8 ضعفًا لمدة 12 دقيقة بعد تحفيز الجاذبية مقارنةً بعناصر التحكم المحفزة ميكانيكيًا. وبالتالي ، فقد تورط Adenosine kinase 1 في أحداث تحويل الإشارة للجاذبية ، ومع ذلك ، لم يتم تحديده في هذه الدراسة ، ربما بسبب أنواع الأنسجة المختلفة المستخدمة (الجذر مقابل السيقان المزهرة). وقد لوحظ أيضًا فسفرة البروتينات المشاركة في الجاذبية بسرعة بعد تحفيز الجاذبية. تشانغ وآخرون. (2003) حدد بروتين قابل للذوبان بقدرة 50 كيلو دالتون تم فسفرته عند تحفيز الجاذبية في أقل من 5 دقائق. كما لوحظت تغييرات في نمط الفسفرة لهذا البروتين بين النصفين العلوي والسفلي من الشوفان الشوفان (Chang et al. ، 2003). من الواضح أن أحداث الجاذبية يتم تنظيمها بعد النسخ وحتى بعد الترجمة.

هنا ، أظهرنا أن تغيرًا سريعًا في وفرة البروتين يحدث بعد تحفيز الجاذبية الباردة أثناء معالجة GPS. من بين 82 بروتينًا تغيرت في التعبير بعد 2 و / أو 4 دقائق ، لم يتم العثور على أي منها في الدراسة التي أجراها Kamada et al. (2005) ، ربما بسبب الاختلافات في الأنسجة المستخدمة (طرف الجذر مقابل الأنسجة الجذعية المزهرة) ، أو النقاط الزمنية التي تم تحليلها (0.5 و 3 ساعات بعد تحفيز الجاذبية مقابل 2 و 4 دقائق بعد تحفيز الجاذبية) ، أو تقنية البروتينات (ثنائي الأبعاد للهلام الكهربائي) مقابل تحليل iTRAQ). بعد 0.5 و 3 ساعات من تحفيز الجاذبية ، حدثت جميع مراحل الجاذبية ، والإدراك ، ونقل الإشارة ، واستجابة النمو ، وبالتالي فإن النقاط الزمنية المستخدمة من قبل Kamada et al. ، (2005) لا تستهدف مرحلة معينة ، وبالتالي فإن قد تكون البروتينات التي تم تحديدها متورطة في الأحداث اللاحقة للجاذبية. تم اختيار النقاط الزمنية التي تم تحليلها هنا لاستهداف أحداث إشارات الجاذبية باستخدام علاج GPS على وجه التحديد.

يمكن للبروتينات الـ 82 التي تم تحديدها كميًا تفاضليًا التي تم تحديدها في هذه الدراسة ، أن تمثل 82 بروتينًا جديدًا تشارك في استجابة النبات للجاذبية. باستخدام تحليل وظيفي كدليل لنا ، اخترنا تحليل بروتينين بعمق أكبر: HSP81-2 و GSTF9 للتحقق من صحة نهج البروتينات. تم الحصول على المسوخ للجينات المشفرة لهذه البروتينات ، والنباتات التي خضعت لتحليل النمط الظاهري. على الرغم من عدم إظهار أي من الطافرين عيوبًا واضحة في النمو ، إلا أن كلاهما أظهر انحناءًا منخفضًا للجاذبية في جذع الإزهار أثناء استجابة GPS (الشكل 8) ، والتلويح غير الطبيعي للجذر والأنماط الظاهرية للانحراف (الأشكال 5 ، 6) ، وتقليل انحناء الجذر بعد تحفيز الجاذبية (الشكل 8). 7). تشير هذه البيانات إلى أن GSTF9 و HSP81-2 يمثلان بروتينات محفوظة في استجابة الجاذبية لأنها مطلوبة للاستجابة الكاملة في كل من الجذور والبراعم.

نظرة ثاقبة على HSP81-2

تم تحديد HSP81-2 في هذه الدراسة لتقليل الوفرة بعد 4 دقائق من تحفيز الجاذبية (الجدول 1). ال hsp81-2 أظهر mutant نمطًا ظاهريًا متغيرًا لانحراف الجذر مقارنة بالنوع البري (الشكلان 5 ، 6 أ) ، واستجابة جاذبية منخفضة في الجذور (الشكل 7) وانحناء منخفض في السيقان المزهرة استجابةً لعلاج GPS (الشكل 8 أ) . HSP81-2 (يشار إليه أيضًا باسم Hsp90.2) هو عضو في عائلة جينات بروتين الصدمة الحرارية 90 (Hsp90). تتكون عائلة الجينات Hsp90 من سبعة أعضاء محددين في أرابيدوبسيس مع اختلاف خصائص الأنسجة (كريشنا وغلور ، 2001). تتمثل الوظيفة الرئيسية لـ Hsp90 في المساعدة في طي البروتين مثل المرافقين الآخرين. تلعب عائلة الجينات Hsp90 دورًا رئيسيًا في مسارات تحويل الإشارة ، والتواصل من خلية إلى أخرى ، والتحكم في دورة الخلية ، والتمايز ، وموت الخلايا المبرمج (Young et al. ، 2001). تم إثبات مشاركة HSP81-2 سابقًا في استجابات إجهاد النبات ، وتحديداً الملح ، وإجهاد الجفاف (Song et al. ، 2009). خطوط الإفراط في التعبير HSP81-2 في أرابيدوبسيس أظهر انخفاضًا في تحمل الملح والإجهاد الناتج عن الجفاف ، ولكن زيادة التحمل لتركيزات الكالسيوم 2+ المرتفعة (Song et al. ، 2009). تشير هذه البيانات إلى أن HSP81-2 متورط في إشارات الإجهاد اللاأحيائية ، ربما من خلال مسار Ca 2+. لقد ثبت أن تدفقات Ca 2+ هي جزء لا يتجزأ من إشارات الجاذبية ، ويمكن أن تعدل HPS81-2 تدفق Ca 2+ المسؤول عن مسار إشارات الجاذبية.

HSP81-2 ليس أول بروتين مرتبط بالصدمة الحرارية يتم إثبات مشاركته في الجاذبية. تم التعرف على Root Handedness 1 (RHA1) من خلال افتقارها إلى الميل الأيمن على ألواح أجار مائلة (Fortunati et al. ، 2008). تم تحديد RHA1 أيضًا كعامل صدمة حرارية (HSF) واقترح مشاركته في مرحلة استجابة auxin في الجاذبية بسبب حساسيته المنخفضة لمثبطات نقل auxin (Fortunati et al. ، 2008). يُعتقد أن HSPs تتفاعل مع البروتينات المحتوية على المجال J في نظام المرافقة الجزيئي لربط ركائز معينة وتعديل نشاطها (Bukau and Horwich ، 1998). الاستجابة المتغيرة للجاذبية 1 (ARG1) و Paralog ARG1-LIKE2 (ARL2) قد ثبت أنه ضروري للاستجابة الجاذبية الكاملة في الجذور و hypocotyls وقد تورط في كونه مكونات متكاملة في مسار إشارات الجاذبية (Boonsirichai et al. ، 2003 Guan et al. ، 2003). يقوم كل من ARG1 و ARL2 بتشفير المجالات J عند الطرف N لبروتيناتهم (Guan et al. ، 2003). يمكن أن يمثل هذان البروتينان شركاء متفاعلين لـ HSP81-2 (أو HSPs أخرى مثل RHA1 ، والتي تعرض أيضًا استجابة جاذبية متغيرة) ، ولكن يجب القيام بالمزيد من العمل لتحديد ما إذا كان مثل هذا التفاعل بين هذه البروتينات موجودًا. يمكن أن يمثل التفاعل بين بروتينات المجال J و HSPs عملية مهمة في أحداث تأشير الجاذبية.

نظرة ثاقبة على GSTF9

GSTs هي عائلة مكونة من 55 إنزيمًا (بتنسيق أرابيدوبسيس) التي عادةً ما تضيف الجلوتاثيون إلى المواد الكيميائية الأجنبية لحماية الخلية من العوامل المؤكسدة (Dixon and Edwards ، 2010). ليس من المستغرب أن معظم هذه الإنزيمات متورطة في استجابات الإجهاد ، ومع ذلك ، فإنها تؤدي أيضًا العديد من الأدوار الأخرى المستقلة عن الجلوتاثيون. تم تحديد اثنين من ضريبة السلع والخدمات في هذه الدراسة: GSTF9 و GSTU20.

شوهدت مستويات متزايدة بشكل ملحوظ من GSTU20 بعد دقيقتين مع مستويات أقل بشكل ملحوظ بعد 4 دقائق (الملحق S3 عبر الإنترنت). لقد ثبت أن GSTU20 يتفاعل مع بروتين مستحث بالأوكسين ، غير حساس للأحمر البعيدة 219 ، باستخدام مقايسة خميرة ثنائية الهجين (Chen et al. ، 2007). يُعتقد أن GSTU20 متورط في تثبيت أو نقل حمض الياسمين (Dixon and Edwards ، 2010). حمض الياسمين متورط في مسار الاستجابة الجاذبية لأن له تأثيرات غير مباشرة على نقل الأوكسين (Muday and Rahman ، 2008). أظهر طفرة ناقصة لحمض الياسمين في الأرز استجابة منخفضة لتحفيز الجاذبية مقارنة بالنوع البري (Gutjahr et al. ، 2005). يعد تركيب الهرمونات وتثبيتها ونقلها أمرًا ضروريًا للسماح باستجابة النمو التفاضلي عند تحفيز الجاذبية. من الواضح أيضًا أن الهرمونات تنسق إشاراتها لاستنباط الاستجابات. يمكن أن يثبت GSTU20 ويسمح بنقل الهرمونات بعد تحفيز الجاذبية لأن مستويات GSTU20 تزداد بعد دقيقتين من تحفيز الجاذبية.

تم العثور أيضًا على زيادة كبيرة في GSTF9 بعد دقيقتين وانخفض بشكل ملحوظ بعد 4 دقائق ، على غرار GSTU20 (الجدول 1 الملحق S3). متحولة gstf9 عرض نمط انحراف جذري مختلف بشكل كبير (الأشكال 5 ، 6 أ) ، واستجابة جاذبية منخفضة في الجذور (الشكل 7) ، وتقليل الانحناء في السيقان المزهرة أثناء استجابة GPS (الشكل 8 أ) مقارنة مع WT. لا يُعرف الكثير عن وظيفة GSTF9 ، ولكن يتم التعبير عنها بشكل أساسي ووفرة للغاية أرابيدوبسيس (واغنر وآخرون ، 2002). بسبب نمط التعبير عن البروتين والنمط الظاهري للجاذبية المتغيرة ، يمكن أن يلعب GSTF9 دورًا في استجابة النبات للجاذبية من خلال تخليق هرمونات النمو أو بعض الآليات الأخرى التي لم يتم تحديدها بعد.

في الختام ، على الرغم من أن اثنين فقط من البروتينات الـ 82 التي تم تحديدها قد تم تحليلها من أجل النمط الظاهري للجاذبية ، إلا أن جميعها يمكن أن تلعب دورًا في نقل إشارة الجاذبية. قد يكشف المزيد من العمل على هذه البروتينات عن جوانب حاسمة مرتبطة بالأحداث المبكرة لنقل إشارة الجاذبية.

اسم الملف وصف
ajb20194-sup-0001.docxapplication / docx ، 17.4 كيلوبايت المواد التكميلية
ajb20194-sup-0002.docxapplication / docx ، 104.7 كيلوبايت المواد التكميلية
ajb20194-sup-0003.docxapplication / docx ، 34.8 كيلوبايت المواد التكميلية

يرجى ملاحظة ما يلي: الناشر غير مسؤول عن محتوى أو وظيفة أي معلومات داعمة مقدمة من المؤلفين. يجب توجيه أي استفسارات (بخلاف المحتوى المفقود) إلى المؤلف المقابل للمقالة.


العمل العملي للتعلم

فئة عملية

توجد الميكروبات في كل مكان ، لكنها في الغالب صغيرة جدًا بحيث لا يمكن رؤيتها بالعين المجردة. يتيح هذا النشاط للطلاب اكتشاف ذلك الميكروبات تم العثور عليها في نطاق اختلاف بيئات، لاستكشاف مجموعة متنوعة من الكائنات الحية الدقيقة من حولنا ومقارنة مجموعة الكائنات الحية الدقيقة الموجودة في أماكن مختلفة. يقدم هذا النشاط أيضًا مهارات التعامل الآمن مع المواد الميكروبية.

يستند هذا العملي على تحقيق يسمى البحث عن الميكروبات وتنميتها (286 كيلوبايت) نشرت في علم الأحياء الدقيقة العملي للمدارس الثانوية © جمعية علم الأحياء الدقيقة العامة.

تنظيم الدرس

أعط كل مجموعة عمل (طالبان) صفيحة أجار مغذية ولوحة أجار واحدة من خلاصة الشعير. يدعم أجار المغذيات نمو مجموعة واسعة من البكتيريا والفطريات من التربة والهواء. يدعم أجار مستخلص الشعير نموًا أفضل للفطريات ، لأن انخفاض درجة الحموضة ومحتوى المغذيات يقلل من المنافسة من البكتيريا. يمكن للطلاب مناقشة الموطن الذي يرغبون في استكشافه وكيفية التأكد من أن نتائجهم ستكون موثوقة. سيحتاج الطلاب أيضًا إلى مناقشة كيف يمكنهم مقارنة نتائجهم بشكل موثوق مع مجموعات أخرى تعمل مع عينات من نفس الموطن ، وكذلك مع مجموعات تعمل مع عينات من موائل مختلفة.

يتم توفير ماء البركة والتربة المعلقة في ماء معقم في أوعية معقمة. ناقش كيفية نقلها إلى لوحات أجار دون إحداث تلوث.

يمكن أن يؤدي اكتشاف مجموعة الميكروبات في البيئة إلى مناقشة مدى صعوبة الاحتفاظ بالعينات والحاويات والمعدات الأخرى غير ملوثة عند إجراء الفحوصات الميكروبية. يمكن ربط هذه الملاحظة بكيفية عمل العلم ، مع مناقشة سبب أهمية تقليل التلوث الجرثومي أو منعه في السياقات التجارية أو الطبية أو الطب الشرعي.

الأجهزة والكيماويات

المواد لكل مجموعة فحص مياه البركة

عبوة معقمة تحتوى على 10 سم 3 من ماء البركة

المواد لكل مجموعة فحص التربة
زجاجة معقمة تحتوي على 1 جرام من التربة معلقة في 100 سم 3 من الماء المعقم

الأجهزة والمواد (كل مجموعة)

لوحة أجار المغذيات ، 1 وصفيحة أجار مستخلص الشعير ، 1

حل VirKon 1٪ وزن / حجم (انظر تعليمات الشركة المصنعة)

ماصات إسقاط معقمة ، 2

مسحات معقمة ، 2 (ملاحظة 1) أو عدد 2 موزع معقم من الزجاج أو البلاستيك

الصحة والسلامة والملاحظات الفنية

للحصول على معلومات مفصلة حول قضايا الصحة والسلامة فيما يتعلق بفحوصات علم الأحياء الدقيقة في المدارس والكليات ، يرجى الرجوع إلى علم الأحياء الدقيقة العملي الأساسي - دليل متاح مجانًا من البريد الإلكتروني لجمعية علم الأحياء الدقيقة العامة (SGM) عنوان البريد الإلكتروني هذا محمي من روبوتات السبام. تحتاج إلى تفعيل جافا سكريبت لتتمكن من مشاهدته. أو انتقل إلى منطقة الأمان على موقع SGM - http://www.microbiologyonline.org.uk/teachers/safety-information

  • لا تجمع الميكروبات للزراعة من المراحيض.
  • لا يتم الزرع من سوائل جسم الإنسان أو الجلد بخلاف اليدين والأصابع.
  • لا تحضن الأطباق فوق 25 درجة مئوية.
  • عكس لوحات أجار قبل الحضانة
  • قم بربط الأغطية وقاعدة ألواح الأجار مع 2-4 شرائط قصيرة من الشريط اللاصق.
  • بعد الحضانة ، ختم اللوحات قبل التفتيش.
  • اتخذ خطوات لقتل الثقافات إذا كان هناك خطر من فتح اللوحات (مثل العلاج بالميثان - ملاحظة 2). وبدلاً من ذلك ، يمكن إحكام غلق الألواح في أكياس بسحاب قبل التفتيش.
  • عد الألواح وإدخالها مرة أخرى إذا كان هناك أي فرصة للطلاب لأخذها بعيدًا. هذه ممارسة جيدة إذا لم يتم معالجة الصفائح بالميثان لقتل الميكروبات.
  • تعقيم الثقافات بعد الاستخدام ، والتخلص منها وفقًا للإرشادات في علم الأحياء الدقيقة العملي الأساسي - دليل (ص 17).

1 قم بإعداد المسحات المعقمة المبللة عن طريق تعقيم أعواد القطن في زجاجات يونيفرسال مع القليل من الماء (انظر كتيب مختبر كليابس 15.2).

2 أوقف نمو الثقافة تمامًا عن طريق وضع قطعة من ورق الترشيح بحجم اللوحة داخل غطاء اللوحة المقلوبة. أضف 40٪ بحذر لنقع ورق الترشيح واستبدل القاعدة. اترك لمدة 24 ساعة. قم بإزالة ورق الترشيح ، وإزالة أي سائل فائض ، وإعادة إحكام إغلاق اللوحة.

قضايا أخلاقية

لا توجد قضايا أخلاقية مع هذا الإجراء.

إجراء

يجب إجراء تقييم كامل للمخاطر قبل الشروع في أي تحقيق عملي ميكروبيولوجي. ارى علم الأحياء الدقيقة العملي الأساسي - دليل (الصفحة 2).

تحضير

علم الأحياء الدقيقة العملي الأساسي - دليل (BMP) لديه معلومات عن التقنيات القياسية ذات الصلة بهذه التجربة.

أ الرجوع إلى التقنيات القياسية للحصول على تفاصيل التعامل مع أجار وإعداد لوحات أجار الخاصة بك ، أو شراء لوحات جاهزة (علم الأحياء الدقيقة العملي الأساسي (BMP) الصفحة 12 انظر الموردين أدناه).

ب قم بإعداد محلول مناسب لتطهير منطقة العمل قبل التحقيق وبعده. تشتمل المطهرات المناسبة على كلورات الصوديوم (I) (هيبوكلوريت) بتركيزات أكبر من 1٪ (راجع CLEAPSS Hazcard 89) ، أو 1٪ VirKon المستخدمة وفقًا لتعليمات الشركة المصنعة (BPM الصفحة 7).

ج تعقيم الماصات إذا لزم الأمر لتلقيح الألواح بالماء أو خليط التربة (BPM ص 7).

د تعقيم الزجاجات الخاصة بجمع العينات (BPM ص 7).

ه تعقيم الناشرات إذا لزم الأمر (BPM ص 7).

F تحضير مسحات معقمة إذا لزم الأمر (ملاحظة 1).

ز تحضير عينة التربة المعلقة في الماء المعقم.

ح اجمع عينة مياه البركة.

تحقيق

أ احتفظ بصفيحة أجار مغذية ولوحة استخراج الشعير غير مفتوحة كعناصر تحكم.

ب قسّم الطلاب إلى 3 مجموعات كبيرة وفقًا للموئل الذي يبحثون عنه - الهواء أو ماء البركة أو التربة. ضمن هذه المجموعات يمكن للطلاب العمل في أزواج.

ج قم بتزويد كل زوج بصفيحتين أجار - أجار واحد للمغذيات وأجار مستخلص الشعير.

د يقوم الطلاب بتسمية كل لوحة في الأسفل بالاسم والتاريخ والموئل.

ه يقوم الطلاب بتلقيح أو كشف لوحاتهم وفقًا للموطن الذي يختارونه. إذا كان الطلاب يستخدمون السوائل - ولكن لا يستخدمون المسحات المعقمة أو الموزعات - فامنح وقتًا لامتصاص السائل في الأجار قبل نقل الطبق.

التعرض للهواء

اختار الطلاب مكانًا لترك كلا صفيحي الأجار مفتوحين في الهواء. يرفعون الأغطية عن كل طبق ويبقونها مفتوحة حتى نهاية الدرس.
ثم يستبدلون الأغطية.

يهز الطلاب زجاجة ماء البركة برفق لخلط المحتويات. يقومون بإزالة الجزء العلوي ، وإشعال عنق الزجاجة في موقد بنسن ، وسحب كمية صغيرة من الماء باستخدام ماصة إسقاط معقمة. يجب حرق الرقبة مرة أخرى واستبدال الجزء العلوي. يرفع الطلاب الغطاء عن صفيحة أجار المغذيات ويوزعون 2-3 قطرات على سطح الأجار. يتخلصون من الماصة في دورق المطهر. ثم يستخدمون رشاش زجاجي معقم أو مسحة لتوزيع القطرات بالتساوي على الأجار. يجب عليهم التخلص من المسحة أو الموزعة في دورق المطهر.

يجب أن يتبعوا نفس الإجراء لصفيحة أجار استخراج الشعير.

علقت التربة في الماء المعقم

يجب على الطلاب اتباع نفس الإجراء لمياه البركة باستخدام زجاجة تعليق التربة.

F يقوم الطلاب بتثبيت الأغطية على اللوحات قبل الحضانة للتأكد من عدم فتحها عن طريق الخطأ. افعل ذلك عن طريق التثبيت بشريطين أو 4 شرائط قصيرة من الشريط اللاصق عند الحواف المعاكسة للصحن. لا تغلق بالكامل - فقد يؤدي ذلك إلى تعزيز نمو مسببات الأمراض اللاهوائية و / أو منع نمو الكائنات الهوائية.

ز قلب الصفائح واحتضانها في درجات حرارة أقل من 25 درجة مئوية لمدة 2-3 أيام. هذا يقلل من خطر استنبات الميكروبات الممرضة في البشر.

ح أحكم إغلاق الألواح وضعها في أكياس بسحاب إذا لزم الأمر.

أنا يلاحظ الطلاب ويصفون ويرسمون المستعمرات على اللوحة.

قد يكون الموقع التالي مفيدًا كنقطة انطلاق للمساعدة في وصف المستعمرات.

ملاحظات التدريس

يمكن أن تكون زراعة الكائنات الدقيقة مثل هذا أمرًا رائعًا للطلاب والمعلمين. إذا كنت أنت أو فنيك غير متأكدين من احتياطات السلامة الضرورية ، فاطلب المشورة من MiSAC / SGM أو CLEAPSS الذين يديرون دورات منتظمة في علم الأحياء الدقيقة العملي الأساسي.

يجب أن يؤدي التعرض لألواح الأجار في أماكن مختلفة ، بعد الحضانة ، إلى نمو البكتيريا والفطريات. قد يكون عدد المستعمرات انعكاسًا لاضطراب الهواء بفعل تيارات الحمل الحراري أو الأشخاص. قد لا يتم الكشف عن الميكروبات في الهواء المضطرب ، حيث يتم تعليقها. من المحتمل أن تنتج التربة والمياه مستعمرات ميكروبية أكثر من الهواء.

يجدر التأكد من فهم الطلاب أن كل مستعمرة في اللوحة النهائية عبارة عن مجموعة من الآلاف أو الملايين من الكائنات الحية الدقيقة. الكائنات الحية الفردية مجهرية وغالبًا ما تكون صغيرة جدًا بحيث لا يمكن رؤيتها بالعين المجردة وهذا هو السبب في أننا يجب أن ننمي مستعمرات على طبق مثل هذا. يحتوي أجار على العناصر الغذائية المناسبة للنمو.

يمكنك تطوير التقييم الذاتي أو تقييم الزملاء لهذه التحقيقات ، واستخدامه كنقطة انطلاق لتخطيط تحقيقات أكثر تعقيدًا.

فحص الصحة والسلامة ، سبتمبر 2008

التحميلات

قم بتنزيل ورقة الطالب Microbes من حولنا (61 كيلوبايت) مع الأسئلة والأجوبة.
قم بتنزيل البروتوكول الأصلي من البحث عن الميكروبات وتناميها من SGM (286 كيلوبايت).

روابط انترنت

جمعية علم الأحياء الدقيقة العامة - علم الأحياء الدقيقة العملي الأساسي - دليل، دليل ممتاز لتقنيات المختبر و علم الأحياء الدقيقة العملي للمدارس الثانوية، مجموعة مختارة من العمليات المجربة والمختبرة باستخدام الكائنات الحية الدقيقة.
www.microbiologyonline.org.uk
البريد الإلكتروني عنوان البريد الإلكتروني هذا محمي من روبوتات السبام. تحتاج إلى تفعيل جافا سكريبت لتتمكن من مشاهدته.

(تم الوصول إلى المواقع الإلكترونية في أكتوبر 2011)

© 2019 ، الجمعية الملكية لعلم الأحياء ، 1 شارع ناوروجي ، لندن WC1X 0GB جمعية خيرية مسجلة رقم 277981 ، تأسست بموجب الميثاق الملكي


عزل بيثيوم oligandrum وغيرها من الطفيليات الفطرية النخرية من التربة

تم فحص عينات من التربة والمواد الأخرى من البستنة والأراضي العشبية والأراضي الصالحة للزراعة والأراضي الحرجية والمياه العذبة والمواقع الساحلية لوجود الطفيليات الفطرية عن طريق الحضانة على الآجار المستعمرة مسبقًا بواسطة فيالوفورا ص. من إجمالي 164 عينة ، 84٪ تحتوي على واحد أو أكثر من الطفيليات الفطرية ، Pythium oligandrum ، Trichoderma viride ، Gliocladium roseum ومجهول بيثيوم ص. ("Pythium SWO").

P. oligandrum تم العثور عليها في 29٪ من جميع العينات ، و 45٪ من العينات من المواقع "المضطربة" (الحدائق ، والأراضي الصالحة للزراعة ، والمراعي المدارة) ، ولكن 11٪ فقط من العينات من المواقع "الطبيعية" المعرضة لأدنى حد من الاضطراب (الأراضي الحرجية ، والأراضي المستنقعية ، والمراعي الدائمة والمواقع الساحلية ورواسب المياه العذبة). كان الأكثر شيوعًا عند درجة الحموضة 5.5.6.5. بيثيوم تم العثور على SWO في 17 ٪ من جميع العينات ولكن ربما تم التقليل من شأنها بسبب المنافسة من P. oligandrum على ألواح العزل. كان توزيعه مشابهًا لتوزيع P. oligandrum، لكنها كانت أقل شيوعًا في مواقع البستنة والمراعي. الطفيل الفطري P. الأقانثيكوم تم العثور عليه مرتين فقط ، و P. periplocum لم يتم العثور عليه ، على الرغم من أن كلاهما يمكن أن ينمو جيدًا فيالوفوراأجار مستعمر. بشكل عام ، تم العثور على بيثيا الفطريات الفطرية في 38 ٪ من العينات - بمعدل تكرار مماثل لـ تي فيريد (45٪) و روزوم (40%).

تي فيريد و روزوم حدثت في أعداد مماثلة من المواقع "الطبيعية و" المضطربة "، وأظهرت أطيافًا مختلفة من الحدوث من بيثيا الطفيليات الفطرية ، على الرغم من وجود الكثير من التداخل.

في التجارب الأولية ، كان خماسي كلورو نيتروبنزين ، والكلورامفينيكول ، وحمض الغاليك ، والأوريوميسين مثبطًا بشكل معتدل أو ملحوظ لكل من الطفيليات الفطرية وغير الفطرية. بيثيوم النيابة. على الرغم من وجود وسيط يحتوي على بنزيل بنسلين وستربتومايسين ونيستاتين وثنائي الفينيل متعدد الكلور ، مع أو بدون الورد البنغال وحمض الغال ، معزول بشكل انتقائي بيثيوم النيابة. من التربة ، لم تكتشف P. oligandrum في تربة معروفة باحتوائها. فيالوفورا- لوحات أجار مستعمرة فعلت ذلك ويمكن استخدامها في تقنية "الرقم الأكثر احتمالًا" لتقدير أعداد P. oligandrum في التربة الجافة.


المواد والأساليب

المواد النباتية وظروف النمو

نبات الأرابيدوبسيس thaliana تم استخدام الشتلات في هذه الدراسة. ال pin1-5 (CS69067) ، eir1-1 (CS8058) ، eir1-4 (CS859601) ، pin4-3 (CS9368) ، pin5-3 (SALK-021738) ، دبوس 6 (SALK-095142) ، pin7-3 (CS9367) ، دبوس 8 (SALK-044651) ، و DR5rev: GFP تم الحصول على بذور (CS9361) من مركز Arabidopsis للموارد البيولوجية (ABRC ، جامعة ولاية أوهايو ، كولومبوس ، أوهايو ، الولايات المتحدة الأمريكية). ال tir1-1 (N3798) ، pin3-4 (N9363) ، fer-4 (N69044) ، aux1-7 (N9583) و DII-VENUS (N799173) تم الحصول على البذور من Nottingham Arabidopsis Stock Center (NASC ، Nottingham ، المملكة المتحدة). ال tir1-1 afb1-1 afb2-1 afb3-1 متحولة رباعية (Dharmasiri وآخرون. ، 2005 ب) و pin3-3 pin4-3 pin7-1 تم وصف بذور متحولة ثلاثية (Waldie & Leyser ، 2018) مسبقًا.

تم تحضين البذور المطهرة السطحية باستخدام 70 ٪ من الإيثانول عند 4 درجات مئوية لمدة 3 أيام ثم نقلها إلى غرفة نمو محددة عند 24 درجة مئوية وعند ج. 50٪ رطوبة. نمت الشتلات على ألواح أجار Murashige و Skoog نصف القوة في أيام طويلة (LDs 16 h: 8 h ، light: dark cycles). تم تطبيق الضوء الأبيض بكثافة 100 ميكرولتر 2 ثانية −1 باستخدام أنابيب الفلورسنت FL40EX-D (التركيز ، بوتشون ، كوريا).

قياس زوايا ثني الجذر

لتجنب العوائق ، نمت الشتلات على ألواح أجار MS الموجهة عموديًا (1 ٪ أجار) لمدة 5 أيام. تم استخدام شفرات BA-400 المقاومة للتآكل (CUTTERMALLKOREA ، سيول ، كوريا) كعقبات. تم تثبيت العوائق رأسياً على ألواح أجار MS ووضعت شتلات عمرها 5 د 2 مم فوق العوائق. تم تصوير نمو الجذور وحركتها كل 20 دقيقة. لقياس معدل الانحناء الأول ، تم قياس الزاوية بين الجذور عند 0 دقيقة وعند نقاط زمنية مشروحة بعد ملامسة الحاجز باستخدام برنامج ImageJ (https://imagej.nih.gov/ij). بالنسبة للانحناء الثاني ، تم قياس الزوايا بين أطراف الجذر والحاجز 200 دقيقة بعد أن لامست الجذور العائق.

المجهر متحد البؤر

هنا ، 5 د DR5rev: GFP أو DII-VENUS تم نقل الشتلات إلى ألواح أجار MS المثبتة على العوائق. لوحظ التألق أثناء الانحناء الأول والثاني 20-40 دقيقة و 150-200 دقيقة بعد أن لمست الجذور العقبات ، على التوالي. لتصور الخلايا الجذرية ، تم غمر الجذور في 10 ميكرومتر من محلول بروبيديوم يوديد (PI) لمدة 30 ثانية قبل ملاحظة التألق. تم وضع الشتلات على زجاج منزلق وخضعت لتصوير مضان باستخدام مجهر LSM 800 متحد البؤر (Carl Zeiss ، Oberkochen ، ألمانيا). تم تحليل صور الإسفار باستخدام برنامج Zen 2.5 lite (https://www.zeiss.com).

لتقدير شدة التألق ، استخدمنا برنامج ImageJ. عند استخدام DR5rev: GFP تم تحليل نباتات المراسل ، شدة مضان GFP في خلايا غطاء الجذر اللاحقة ، والتي تقع عند 100-200 ميكرومتر من طرف الجذر لتحديد توزيعات الأكسين الجانبية. كما تم قياس شدة التألق PI في نفس المنطقة كعناصر تحكم.

العلاج الدوائي

ل ن-1-naphthylphthalamic acid (NPA Sigma-Aldrich، St Louis، MO، USA، cat. no. 33371)، 5- (4-chlorophenyl) -4H-1،2،4-triazole-3-thiol (yucasin Carbosynth، Berkshire، UK cat. no. FC122238) و l-kynurenine (l -Kyn Sigma-Aldrich cat. no. K8625) ، تم نقل الشتلات البالغة من العمر 5 د المزروعة على ألواح أجار MS إلى اللوحات المثبتة على العوائق التي تحتوي على 25 ميكرومتر NPA ، 50 ميكرومتر يوكاسين ، أو 1 ميكرومتر l -Kyn. نمت الجذور ل ج. 5 ساعات في الوسط قبل الاتصال بالعائق. من أجل معالجة حمض رباعي الخليك الإيثيلين جلايكول (EGTA) ، تم نقل الشتلات التي يبلغ عمرها 5 د إلى ألواح تحتوي على 2 ملي مولار من EGTA قبل قياس تجنب العوائق. نظرًا لاستخدام ما يصل إلى 10 ملم EGTA لمنع إشارات Ca 2+ في Arabidopsis (Zhang & Mou ، 2009 Ma وآخرون. ، 2017) ، طبقنا 2 مم EGTA في هذه المقالة.

تحليل احصائي

تم تحليل الدلالة الإحصائية بين وسيلتين من القياسات باستخدام الطالب ر-اختبار مع ص- القيمة & لتر 0.05. تم توضيح عدد المضاعفات في وسيلة إيضاح الشكل. يتم عرض البيانات الكمية على أنها الانحرافات المعيارية للمتوسط ​​(SD).


مناقشة

توفر الميزات المعيارية لمروّجات الخميرة مساحة لتصميم وتوليف المروجين الاصطناعي الذي يعزز التعبير الجيني عالي الكفاءة. ومع ذلك ، امتلكت الوحدات الرئيسية زخارف قاعدية محافظة للغاية ولا تقدم سوى مساحة صغيرة لإعادة التصميم [15 ، 16]. اختار عمل Redden العديد من مواقع التنشيط الأولية الصناعية (UAS) وعناصر المروج الأساسية ذات الأداء الجيد من أكثر من 10 6 خيارات [8]. قدمت عملية تحليل FACS والمستعمرة والتسلسل إجراءً قياسيًا لاختيار المروج. في عملنا ، ارتبطت قوة المروج المعاد تصميمه بالتعبير عن إنزيم معين CrtY (الشكل 1). نتيجة لذلك ، قدمت سلالات الخميرة ذات المستوى الأولي المختلف من اللايكوبين تحول اللايكوبين إلى بيتا كاروتين للتمييز بين النطاقات (ملف إضافي 1: الشكل S2). جمع عملنا بشكل مباشر بين الطلب على تحسين التمثيل الغذائي في Y. ليبوليتيكا مع هندسة المروجين ، مما يوفر نهجًا للفحص السريع للمروجين الاصطناعي. تم ضم الأقسام الثلاثة المكونة من 10 عناصر من مادة T-rich أو عناصر G / C الغنية معًا باعتبارها القواعد 30 الاصطناعية من المروجين الأساسيين Y. ليبوليتيكا (الجدول 1).

The options of different promoter upstream sequences and different starting strains affected the variance of colony-color distribution, facilitating the screening of desirable engineered promoters. It was suggested that the higher metabolic flux could be an amplifier of the impacts of engineered promoters (Fig. 2). The HE and HG libraries showed obvious large amounts of orange colonies besides yellow colonies than the LE and LG libraries, implying the different ratios of lycopene and beta-carotene with much higher yields would obviously affect yeast phenotype to different extents. Different promoter’s upstream sequences also introduced different influences. تم العثور على PEXP1 with 30 artificial bases were more susceptible than PGPD, as the red-color colonies of different HE libraries covered around 5.5–65% but all HG libraries remained 53% red-color colonies. صGPD was more robust than PEXP1.

The different yields of lycopene and beta-carotene produced by the selected strains showed that not all the artificial promoters remained active (Fig. 3). Some red colonies like LE1-Y1, LE6-Y3 and HE6-R did not produce beta-carotene, implying the absence of the activity of CrtY. The selected best-performed artificial core promoters like LE7-Y1, LG7-Y1 and HG3-O1 obtained typical more T-rich elements or higher T-percentage than weak promoters (Additional file 1: Tables S2, S3). Portola’s recent work observed no meaningful correlation between nucleosome occupancy and promoter strength, not in accordance with previous opinion that AT rich sequences were associated with low nucleosome affinity and high promoter activity [27, 28]. Our work here found that the artificial strong promoters and natural strong ones both shared the common feature of T-rich elements and higher T-percentage. The conclusion was also verified when the best-performed artificial core promoters were combined with other upstream promoter sequences (Fig. 4).

The selected champion promoters in HE and HG libraries still did not transformed all the substrate lycopene into beta-carotene (Fig. 3, Additional file 1: Figure S4). This meant the starting high level of lycopene offered enough space for selection of improved promoters. The redesigned artificial promoters share different base orders and lengths from the traditional sequences. The de novo designed characteristic allows unique and orthogonal targeting of the promoter, which can be used as barcode. The unique barcode is beneficial to tuning and analysis of gene expression, targeting and recombination. Due to their diversity and independence of natural sequences, the artificial core promoters are valuable to the research of synthetic biology at pathway and genome level.


مناقشة

Individual cell morphology varies widely within and across bacterial species (50, 51), but in most cases it is not clear how cell shape relates to emergent structure and ecology of cell collectives such as biofilms. Here we have found that some isolates of ضمة الكوليرا produce long cell filaments under nutrient-limited media, including conditions closely matched to the natural marine environment. This cell morphology generates a pronounced advantage in chitin surface colonization and a matrix-independent biofilm architecture that permits rapid surface occupation and high dispersal rates. However, this advantage comes at a cost: Filamentous biofilms are ultimately displaced by matrix-secreting strains in long-term competition experiments. Filamentation is thus advantageous when patches of chitin turn over quickly, such that faster colonization and reversible attachment are more important. Our results demonstrate that the shape of ضمة الكوليرا variants can tune the relative investment into surface colonization, long-term biofilm robustness, and dispersal back into the planktonic phase. These are fundamental elements of fitness for any biofilm-producing microbe (13, 52), and they are especially important for the marine ecology of ضمة الكوليرا as it colonizes, consumes, disperses from, and then recolonizes chitin in its marine environment.

Bacterial cell shape can serve a broad range of adaptive functions (49 ⇓ –51). The curved shape of Caulobacter crescentus, for example, promotes the formation of biofilms as hydrodynamic forces reorient single cells to optimize daughter cell attachment (53) this process also nucleates clonal clusters under strong flow (54, 55). Simulations and experiments with engineered variants of الإشريكية القولونية suggest that rod-shaped bacteria can obtain a competitive advantage over spherical cells in colonies on agar plates, because rod-shaped cells burrow underneath spherical cells and spread more effectively to access fresh nutrients on the colony periphery (56). Filamentation has been observed in a wide variety of bacteria and eukaryotic microbes this morphology is implicated in assisting spatial spread through soil or host tissue and defense against phagocytosing amoeboid predators (50, 57, 58). In this work, we have shown that filamentation can alter surface colonization, biofilm architecture, and, as a result, the relative investment into rapid surface occupation versus long-term competitive success in biofilms.

The biophysical bases of our results are a topic of future work, but here we note that single filaments of ضمة الكوليرا can rapidly bend in shear flow, despite the stiffness of the bacterial cell wall (59). Our results demonstrate that sufficiently long bacteria can behave as elastic filaments (60). In analogy with the stretching behavior of polymers in flows that approach and split at the interface with an obstacle (i.e., extensional flows), we expect that filamentous bacteria experience shear that stretches them into alignment with stationary surfaces in the flow path (61 ⇓ –63). This phenomenon presumably increases the dwell time and contact area of filaments in proximity to obstacles in flow (الملحق SI, Fig. S12). We speculate that this process, in conjunction with previously known surface-adhesion mechanisms such as MSHA pili (46, 47), promotes rapid attachment and wrapping of filaments around chitin particles (الملحق SI، الشكل S6).

Following surface attachment, filamentation allows the construction of biofilms in which cell–cell contacts generate a mesh network that is not dependent on the major polysaccharide or cell–cell adhesion components of the ضمة الكوليرا biofilm matrix. In this respect, filamentous biofilms may be analogous to a polymeric gel in which elongated cell bodies are directly associated through physical entanglement (64). Here, this cell network is more natively inclined to fast surface spreading and subsequent dispersal but also porous and prone to physical invasion by competing strains or species (الملحق SI, Fig. S10). This strategy of rapid colonization and biomass accumulation but high reversibility of surface association is particularly well suited to fluctuating environments in which resource patches are short-lived. This could be the case when particles are small and quickly consumed, or when disturbance events are common and destroy or disrupt particles with high frequency.

Understanding the transitions between individual cell behavior and collective properties that emerge among biofilm-dwelling bacteria is a topic of increasingly intense interest in the microbiology community. Our results here suggest that changes in cell shape are a fundamental element of this individual-to-collective transition. ل ضمة الكوليرا, and potentially other microbes producing biofilms on and dispersing from particle to particle, filamentation may offer a surface-occupation strategy better suited to transient environments by shifting a biofilm’s ability to spread over surfaces, at the expense of long-term competitive ability against matrix-replete, more highly adhesive cell groups. The ecological scope and impact of this cell morphology for ضمة الكوليرا and its relatives in realistic multispecies communities remain open questions for future work.


شاهد الفيديو: مش كفايه دراما.. الكونجرس مش عايز يمرر القوانين التي تزيح هموم الأسر الأمريكية (ديسمبر 2022).