معلومة

ما هو "النظام المفتوح" عندما يتعلق الأمر بأجهزة تفاعل البوليميراز المتسلسل؟

ما هو


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

لقد سمعت مصطلح "الأنظمة المفتوحة" ، كما هو الحال هنا عندما يتعلق الأمر بأجهزة RT-PCR ، لكنني لست متأكدًا بنسبة 100٪ مما يعنيه هذا ، فهل هذا يعني أنه يمكنك شراء الأجهزة بنفسك؟ مثل هذا؟ ... مقارنة مع واحد يمكن أن يكون في المختبر؟

أيضًا ، سمعت أنهم يأتون مع بيان أنهم لأغراض بحثية فقط ولا ينبغي استخدامها كأداة تشخيص ، فهل هذا لأن أي شخص يمكن أن يشتريها؟


في نظام مفتوح ، "يتم الكشف عن mRNAs بسبب خاصية التعبير عنها في عينة الأنسجة المعزولة للدراسة. هذا النهج على عكس ما يسمى نهج النظام المغلق ، حيث يتم اختيار mRNAs المراد اكتشافها كمرشحين في تقدم التحليل ؛ مثال معاصر على نظام مغلق سيكون تجربة تهجين "رقاقة" للجينات ". [ساتكليف ، ج. (2001) J. نيوروسسي. 21: 8306-9. "مناهج النظام المفتوح للتعبير الجيني في الجهاز العصبي المركزي"] https://doi.org/10.1523/JNEUROSCI.21-21-08306.2001


بناءً على هذه الورقة ، يبدو أن غالبية (إن لم يكن كل) فحوصات PCR في الوقت الحقيقي هي نظام مغلق عند مقارنتها بـ PCR التقليدي ويبدو أن السبب الرئيسي للأنظمة المغلقة هو تقليل التلوث - كل هذا مفصل أدناه:

PCR في الوقت الحقيقي مقابل PCR التقليدي:

توفر منصات اختبار PCR في الوقت الحقيقي حساسية وخصوصية مكافئة مثل PCR التقليدي جنبًا إلى جنب مع تحليل اللطخة الجنوبية. منذ أن يتم إجراء تضخيم الحمض النووي وخطوات الكشف في نفس الوقت وعاء مغلق، فإن خطر إطلاق الأحماض النووية المتضخمة في البيئة ، وتلوث التحليلات اللاحقة ، مهم مقارنة بطرق PCR التقليدية.

تقليل مخاطر التلوث:

يقضي النظام المغلق للتضخيم والكشف المستخدم مع تفاعل البوليميراز المتسلسل في الوقت الفعلي فعليًا على تلوث الأمبليكون الناجم عن فتح وإغلاق أوعية التفاعل التي تمثل مشكلة مع طرق الكشف التقليدية وتفاعل البوليميراز المتسلسل. حتى مع النظام المغلق لـ PCR في الوقت الفعلي ، قد يظل المختبر يختار إضافة uracil-N-glycosylase إلى مزيج PCR لمستوى آخر من التحكم في تلوث amplicon.

… و:

خطر التلوث أقل بكثير مع تفاعل البوليميراز المتسلسل في الوقت الحقيقي مقارنةً بتفاعل البوليميراز المتسلسل التقليدي ، ولكن لا يزال من الممكن حدوثه (341). نظرًا لأن تضخيم تفاعل البوليميراز المتسلسل في الوقت الحقيقي يتم إجراؤه في نظام مغلق ، فليست هناك حاجة لغرف فردية يتم التحكم فيها بالهواء كما هو موصى به في تفاعل البوليميراز المتسلسل التقليدي. في تجربتنا مع تفاعل البوليميراز المتسلسل في الوقت الحقيقي ، أصبحت عينة عينات التلوث تحديًا أكبر من تلوث المنتج المتضخم. الموقف الأكثر وضوحًا حيث يمكن أن يحدث تلوث من عينة إلى عينة هو نقل العينة إلى وعاء PCR أو إلى أنبوب استخراج الحمض النووي. يجب توخي الحذر لتجنب تلوث جهاز الماصة بالعينة وتجنب تكوين رذاذ عن طريق نفخ العينة من الطرف.

بالنسبة لسؤالي الثانوي حول عبارات "استخدام البحث فقط" التي لاحظتها ؛ هذا ليس واضحًا تمامًا ، ولكن مع افتراضي الأصلي ، وجدت أيضًا ما يلي:

تشير صفحة CDC هذه بعض الاشعال والمسبار RT-PCR في الوقت الحقيقي هذا ل ليس لاستخدام الاختبار الفيروسي ثم يمضي ليقول:

لا يمكن استخدام سوى البادئات والتحقيقات التي تم تصنيفها لاستخدام EUA وتوزيعها بواسطة International Reagent Resource للاختبار الفيروسي باستخدام لوحة تشخيص RT-PCR في الوقت الحقيقي CDC 2019-nCoV.

إذن أحد الأسباب هو أنه قد يكون متعلقًا بالموافقة / قضايا الروتين؟

يبدو أن هذا ممكن أيضًا مع المنتجات الأخرى:

https://www.diagnostictechnology.com.au/products/altona-realstar-sars-cov-2-rt-pcr-kit https://www.sigmaaldrich.com/catalog/product/roche/tosrtro

أحد الاحتمالات الأخرى هو أنه ببساطة لأنه قد يكون بدون شراكة مع مختبر طبي:

https://johner-institute.com/articles/regulatory-affairs/and-more/coronavirus/

ب) نهج البحث فقط

يفكر بعض المصنّعين في بيع أجهزتهم "للاستخدام البحثي فقط" بدون شراكة مع مختبر طبي. يمكن للمختبرات الطبية بعد ذلك استخدام هذه الكواشف لتقديم اختبار معملي مطور.

ومع ذلك ، يجب النظر إلى هذا النهج بشك ، حيث يمكن اعتبار عبارة "استخدام البحث فقط" بمثابة مطالبة ذاتية لا تعكس الغرض الفعلي المقصود: المنتج لأغراض التشخيص.


شاهد الفيديو: 7 PCR تفاعل البلمره المتسلسل (شهر فبراير 2023).