معلومة

بروتوكول سحب نقاط توقف الحمض النووي؟

بروتوكول سحب نقاط توقف الحمض النووي؟


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

هل هناك أي طريقة للقيام بإثراء منسحب لنقاط توقف الحمض النووي من الخلية؟ لقد وجدت هذه الورقة التي تبلغ عن طريقة لإثراء نقاط توقف الحمض النووي أحادية الخيط من أحداث إعادة التركيب الانقسام الاختزالي:
خيل ب ، Smagulova F ، Brick KM ، Camerini-Otero RD ، Petukhova GV. 2012. رسم خرائط حساسة للنقاط الساخنة لإعادة التركيب باستخدام الاكتشاف القائم على التسلسل لـ ssDNA. أبحاث الجينوم 22: 957-65.

أود أن أعرف ما إذا كان هناك شيء من هذا القبيل سيعمل على أي حالة لدورة الخلية ، وليس فقط الانقسام الاختزالي.


تقول الورقة البحثية التي استشهدت بها إن نقاط الانكسار عبارة عن حمض نووي منفرد مجدول له بروتينات معينة مرتبطة بها.

لست خبيرًا هنا ، ولكن إذا كان هذا هو سبب نقاط الانهيار الانتصافي ، فهناك بعض الاحتمالات المثيرة للاهتمام لاكتشافها:

يمكنك اكتشافها باستخدام صفيف تبليط. - هذه مصفوفة صغيرة تحتوي على أوليغومر كل 40 نقطة أساس أو نحو ذلك من الجينوم. يمكن استخدام المصفوفة في تجربة CHP التي تكتشف نفس البروتينات الموجودة في هذه الورقة.

من الممكن أن تتمكن المجموعة من تهجين الحمض النووي المفرد الذي تقطعت به السبل من الجينوم أيضًا إذا كانت الظروف مناسبة. هذا يبدو صاخبا بالرغم من ذلك.

على الجانب الرخيص ، قد يكون من الممكن استخدام تفاعل البوليميراز المتسلسل لنسخ الحمض النووي المفرد الذي تقطعت به السبل من إعداد الحمض النووي الصبغي. إذا تم تصنيف oligos التي تستخدمها بـ streptavidin ، فيمكنك عزلها وإعادة تضخيمها وتسلسلها بثمن بخس.

أي من هذه الأمور تبدو وكأنها عمل جيد :)


الجواب هو نعم ، ليس فقط الانقسام الاختزالي ، ولكن سيتم اكتشاف أي فواصل مزدوجة في الحمض النووي طالما تتم معالجتها عن طريق إعادة التركيب المتماثل. تعتمد هذه الطريقة (SSDS) على اكتشاف نهايات ssDNA المقطوعة عند DSBs. سيكون الاختلاف الوحيد في الفواصل الانقسامية هو أنه لا يمكنك استخدام مضاد DMC1 لـ ChIP. بدلاً من ذلك ، يجب عليك استخدام إما anti-Rad51 أو anti-RPA في ChIP.


شاهد الفيديو: علم الأحياء تحت المجهر: ما الحمض النووي والحمض النووي الريبي (شهر فبراير 2023).